Ποια είναι η διαφορά μεταξύ ενός ανταγωνιστικού ενδογενούς RNA και ενός ncRNA σε έναν άξονα mRNA του ncRNA-miRNA; Ή είναι ακριβώς παρόμοια;


Απάντηση 1:

TL. Το DR - ncRNA σημαίνει μη κωδικοποιητικό RNA. Το ceRNA είναι ένας τύπος μη κωδικοποιητικού RNA.

Σε βάθος εξήγηση - Αυτό είναι ένα νόστιμο lol. Ας ξεκινήσουμε με ορισμένους ορισμούς, δεδομένου ότι οι περισσότεροι άνθρωποι που διαβάζουν αυτό πιθανότατα δεν έχουν το υπόβαθρο για να κατανοήσουν την ερώτηση χωρίς 20 λεπτά googling.

Το RNA - DNA δεν χρησιμοποιείται από το κύτταρο άμεσα για τους σκοπούς μας εδώ. Αντ 'αυτού, ένα ένζυμο (μηχανή πρωτεΐνης) που ονομάζεται πολυμεράση RNA μεταφράζει το ϋΝΑ σε mRNA. Είναι το mRNA που συνήθως βγαίνει στα κύτταρά σας λέγοντας ριβοσώματα (πρωτεϊνικά εργοστάσια) ποιες πρωτεΐνες πρέπει να κάνουν, κ.λπ. Το RNA κάνει πολλά άλλα πράγματα επίσης, τα περισσότερα από τα οποία εξηγούνται είτε παρακάτω είτε εκτός του πεδίου εφαρμογής αυτής της ερώτησης.

Τα miRNAs - τα μικρά RNAs είναι σύντομα (22ish νουκλεοτίδια) σειρές RNA που δεν κωδικοποιούν τις πρωτεΐνες αλλά έχουν άλλες ρυθμιστικές λειτουργίες. Χωρίς να πάμε πολύ βαθιά στις λεπτομέρειες, τα miRNAs μπορούν να χρησιμοποιηθούν για να ρυθμίσουν την έκφραση πρωτεΐνης δεσμεύοντας το mRNAs. Το mRNA είναι αυτό που συνήθως σκέφτεστε όταν ακούτε RNA - ένα αντίγραφο ενός γονιδίου στο DNA που αποστέλλεται στο κύτταρο για να κάνει τη συσχετιζόμενη πρωτεΐνη ή να κάνει ό, τι κάνει το γονίδιο. Φαίνεται να θυμάμαι ότι τα miRNAs εξάγονται περιστασιακά από τα κύτταρα ως μόρια messenger, αλλά είναι έξω από το πεδίο της ερώτησης, οπότε δεν θα ασχοληθώ με το κυνήγι για παράδειγμα.

Πηγή εικόνας

Ανταγωνιστικά ενδογενή RNA (ceRNAs) - Αυτά ρυθμίζουν μερικές μεταγραφές RNA ανταγωνίζονται για miRNAs. Συγκεκριμένα, θεωρητικά θεωρείται ότι δεσμεύονται με miRNA με τον ίδιο τρόπο που το mRNA στόχου του miRNA θα απομονώσει ("να χρησιμοποιήσει") το miRNA.

το μη κωδικοποιητικό RNA - ncRNA τυπικά εξυπηρετεί κάποιο σκοπό διαφορετικό από το να παράγει μια πρωτεΐνη. Το miRNA και το ceRNA είναι τεχνικά ncRNAs.

Παρακολουθήστε την τρύπα του κουνελιού για ένα λεπτό, γιατί αυτό μπορεί να είναι άγνωστο σε μερικούς ανθρώπους. Κάτι προκαλεί το κύτταρο να χρειάζεται να κάνει κάτι που περιλαμβάνει το DNA. Το εν λόγω γονίδιο αντιγράφεται σε mRNA με πολυμεράση RNA και αποστέλλεται από τον πυρήνα σε ριβοσώματα. Τα ριβοσώματα είναι τα εργοστάσια πρωτεϊνών που μετατρέπουν το mRNA σε πρωτεΐνες. Οι πρωτεΐνες είναι τα δομικά στοιχεία των κυττάρων. ίσως το 70% του ξηρού βάρους ενός τυπικού ανθρώπινου κυττάρου είναι πρωτεΐνες.

Μερικές φορές ένα κύτταρο δεν θέλει να κάνει πολλά από ένα mRNA. Ίσως το mRNA να κωδικοποιεί κάτι που πρέπει πάντα να είναι έτοιμο να κάνει με μια στιγμή, αλλά δεν θέλει να κάνει συνεχώς επειδή είναι σπατάλη. Πληκτρολογήστε miRNA. Το miRNA συνδέεται με το mRNA με τον ίδιο γενικό τρόπο που δύο κλώνοι ϋΝΑ συνδέονται μεταξύ τους. Εάν το miRNA δεσμεύεται στο mRNA, τα ριβοσώματα (τα πρωτεϊνικά εργοστάσια) δεν μπορούν να χρησιμοποιήσουν το mRNA επειδή δεν θα χωρέσουν στον "μεταφορικό ιμάντα" του. Το mRNA εξακολουθεί να υπάρχει, αλλά δεν μπορεί να χρησιμοποιηθεί για τίποτα επειδή είναι συνδεδεμένο στο κελί. Στη βιοχημεία, αποκαλούμε αυτή την απομόνωση. Το mRNA που δεσμεύεται στο miRNA είναι διπλής όψης RNA (dsRNA). Το dsRNA είναι γενικά στοχευμένο για υποβάθμιση γρήγορα επειδή μερικοί ιοί το χρησιμοποιούν, αλλά όχι πάντα.

Το miRNA ρυθμίζει την γονιδιακή έκφραση μέσω της απομόνωσης του mRNA, εμποδίζοντας το μετασχηματισμό του mRNA (το πρώτο προϊόν ενός δεδομένου γονιδίου) από το ριβόσωμα σε πρωτεΐνη (το τελικό προϊόν ή τουλάχιστον την αρχή του τελικού προϊόντος). Το ncRNA μπορεί στην πραγματικότητα να δεσμεύει miRNA με υψηλότερη ή συγκρίσιμη συγγένεια με το mRNA, απομονώνοντας έτσι το miRNA. Επομένως, το miRNA μειώνει την έκφραση του γονιδίου, αλλά το ncRNA μειώνει τον ρυθμιστή, ρυθμίζοντας έτσι την έκφραση του γονιδίου.

Λοιπόν, το ρωτήσατε.

Έτσι, για τους σκοπούς αυτού του συγκεκριμένου παραδείγματος, το ceRNA και το ncRNA είναι εναλλάξιμα, εφόσον το ceRNA είναι ένας τύπος ncRNA. Δεν είναι πάντοτε εναλλάξιμα - μόνο σε αυτό το συγκεκριμένο παράδειγμα. Ελπίζω αυτό να σας βοηθήσει.

Εδώ είναι ένα κομμάτι της βιβλιογραφικής ανάγνωσης που εξηγεί σε κάποιο βαθμό: Η κατασκευή των δικτύων mRNA του lncRNA-miRNA αποκαλύπτει τα λειτουργικά lncRNAs στο κοιλιακό αορτικό ανεύρυσμα